Важное значение имеет расстояние от термической камеры до шампиньонницы. Если после посадки мицелия и наполнения мешков субстратом их переносят в шампиньонницу, то субстрат в них обычно несплющенный и равномерно уплотнен, что значительно облегчает дооформление его поверхности в шампиньоннице.
Если мешки доставляют грузовым транспортом от камеры, расположенной в нескольких километрах от шампиньонницы (особенно без поддонов), то субстрат в мешках сильно деформируется и его часто необходимо дополнительно разравнивать и оформлять в шампиньоннице.
Опыт показывает, что если в момент посева мицелия температура субстрата не превышала 25 °С, то транспортировка мешков без поддонов на расстояние до 300 км в течение 24 ч не отражается пагубно на мицелии. Не оказывает значительного влияния и время года. Например, в зимние месяцы субстрат охлаждается только в крайних боковых и верхних мешках в кузове. В жаркие летние месяцы после продолжительной транспортировки (Русе—Пловдив) в отдельных мешках температура может повышаться до 29 °С. Только один раз, и в отдельных мешках, была отмечена температура, равная 33 °С, что не оказало отрицательного влияния на мицелий. Грузовую автомашину, загруженную мешками, необходимо укрыть чистым брезентом, чтобы избежать запыления субстрата при транспортировке.
В практике соблюдают такое правило: полные мешки с посеянным и перемешанным мицелием перевозят на грузовой машине без поддонов, нагруженной до уровня бортов, но хранят их в таком толстом слое в любой сезон года не более 48 ч.
Субстрат доставляют по возможности ближе к шампиньоннице и начинают разгрузку. Мешки желательно сразу вносить в помещение и ставить их на место. Чтобы быстро разгрузить машину, мешки следует ставить на чистую и продезинфицированную площадку или на предварительно разостланную чистую полимерную пленку или брезент. После этого мешки с субстратом вносят в шампиньонницу, так как при их продолжительном хранении под открытым небом, особенно летом, грибные мухи могут отложить яйца в субстрат. Кроме того, солнце и ветер иссушают поверхность субстрата в мешках.